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基本信息
·出版社：化学工业出版社
·页码：235 页
·出版日期：2004年03月
·ISBN：7502556494
·条形码：9787502556495
·页码：235 页
·出版日期：2004年03月
·ISBN：7502556494
·条形码：9787502556495
·版本：第1版
·装帧：平装
·开本：16
·正文语种：中文
·装帧：平装
·开本：16
·正文语种：中文
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内容简介
计算分子生物学是数学、计算机科学和生物科学业交叉的新兴领域之一。本书覆盖了算法和组合问题的主要领域，并揭示了这些问题是如何同分子生物学和生物技术相联系的。本书包含一个内容丰富的“无公式的计算分子生物学”部分，用相对简单的方式介绍了生物学概念和计算思想，但涉及的内容却是许多基因组基本问题及其结果的核心思想。本书力求通俗的写法表达如何用深刻的数学思想解释复杂的生物学难题，这使得没有经过生物学训练的计算机科学家和只有有限的计算科学背景的生物学家都能够理解本书。本书适合作为数学、计算机科学、生物信息学、生物物理学等交叉学科的教材，也可作为相关专业研究人员的参考书。
目录
第1章 计算基因搜寻
1.1 引言
1.2 遗传作图
1.3 物理作图
1.4 测序
1.5 相似性搜寻
1.6 基因预测
1.7 突变分析
1.8 比较基因组
1.9 蛋白质组学
第2章 限制酶切作图
2.1 引言
2.2 双酶切问题
2.3 双酶切问题的多重解
2.4 着色图中的交错圈
2.5 交错欧拉圈的变换
2.6 物理图谱与交错欧拉圈
2.7 部分酶切的问题
2.8 同交效集
2.9 若干其他的问题和方法
第3章 图谱装配
3.1 引言
3.2 非惟一探针的作图
3.3 惟一探针的作图
3.4 区间图
3.5 用限制酶切片段指纹图谱作图
3.6 若干其他的问题和方法
第四章 测序
4.1 引言
4.2 重叠、排列和共有序列
4.3 双管鸟枪测序
4.4 若干其他的问题和方法
第5章 DNA阵列
5.1 引言
5.2 杂交测序
5.3 SBH和最短超字符串问题
5.4 SBH和欧拉路问题
5.5 惟一序列重构的概率
5.6 字符串重排
5.7 2-最优欧拉圈
5.8 杂交法定位测序
5.9 DNA阵列的设计
5.10 DNA阵列的分辨率
5.11 多探针阵列与均匀阵列的比较
5.12 DNA阵列的制造
5.13 若干其他问题和方法
第6章 序列比较
6.1 引言
6.2 最长共同子序列问题
6.3 序列联配
6.4 局部序列联配
6.5 有缺口罚分的联配
6.6 空间效率高的序列联配
6.7 杨氏表
6.8 最长区同子序列的平均长度
6.9 广义序列联配和对偶性
6.10 序列比较的原始对偶方法
6.11 序列联配和整数规划
6.12 近似字符串匹配
6.13 依靠数据库的序列比较
6.14 多重过滤
6.15 若干其他的问题和方法
第7章 多重联配
7.1 引言
7.2 计算多重联配的得分
7.3 装配成对联配
7.4 多重联配的近似算法
7.5 装配ι-路联配
7.6 点阵和图像重构
7.7 点阵相乖的多重联配
7.8 若干其他的问题和方法
第8章 发现DNA中的信号
8.1 引言
8.2 Eegar Allan Poe 和DNA语言学
8.3 适合傻子的最好的赌博
8.4 Conway等式
8.5 DNA中的频繁词
8.6 共有词的分析
8.7 CG岛和“公平赌场”
8.8 隐马氏模型
8.9 Elkhorn赌场和隐马氏模型参数估计
8.10 剖面隐马氏模型联配
8.11 吉布斯抽样
8.12 若干其他的问题和方法
第9章 基因预测
9.1 引言
9.2 基因预测的统计学方法
9.3 基于相似性的基因预测方法
9.4 剪接联配
9.5 反向基因搜索和cDNA中外显子定位
9.6 关于基因的多次提问策略
9.7 可变剪接与癌症
9.8 若干其他的问题和方法
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